Proteomikai Kutatócsoport

DARULA Zsuzsanna

Laboratórium vezető

Tel: 36-62-599-773

A Proteomikai Kutatócsoport fehérje- és peptid minták tömegspektrometriás analízisével segíti az SzBK és a HCEMM kutatócsoportjainak munkáját, a szabad kapacitás függvényében egyéb akadémiai és ipari partnerektől is fogadunk mintákat.

SZOLGÁLTATÁSOK

Vállaljuk fehérjék és fehérjeelegyek kvalitatív és kvantitatív tömegspektrometriás jellemzését, ami az alábbiakat foglalhatja magában:

Mintaelőkészítés

Fehérje komplexek affinitás izolálása ko-immunprecipitációval
Fehérjék proteolízise oldatban, vagy gélszeparált mintákban különböző endoproteázokkal (tripszin, kimotripszin, endoproteináz GluC, endoproteináz LysC)
Magas pH-jú reverz fázisú kromatográfia komplex peptidminták frakcionálására
Peptidek stabil izotópos jelölése (TMT) relatív mennyiségi meghatározáshoz
Peptidminták tisztítása C18 szilárd fázisú extrakcióval
Foszfopeptid izolálás immobilizált fém-affinitás kromatográfiával

Tömegspektrometriás analízis és adatértelmezés

LC-MS/MS analízis CID, HCD és/vagy ETD fragmentációs technikával
Fehérje azonosítás adatbázis kereséssel (Protein Prospector, Byonic, Mascot)
Relatív fehérje mennyiségi meghatározás jelölésmentes és izobár jelöléses (TMT) módszerekkel (Proteome Discoverer, Skyline)

INFRASTRUKTÚRA

Tömegspektrometria

Orbitrap Fusion Lumos Tribrid (Thermo)

Orbitrap Elite (Thermo)

LCQ Fleet (Thermo)

Folyadékkromatográfia

ACQUITY UPLC M-Class system (Waters) – on-line kapcsolva az OT Lumos készülékkel

nanoAcquity UPLC system (Waters) – on-line kapcsolva az OT Elite készülékkel

Jasco és Eldex HPLC rendszerek peptid minták offline frakcionálására

Kérjük vegye fel velünk a kapcsolatot a mintaelőkészítés megkezdése előtt, hogy meghatározhassuk a legmegfelelőbb módszert mintái analíziséhez! A mintaelőkészítéssel kapcsolatos tanácsainkért kattintson ide.