Proteomikai Laboratórium
A HUN-REN SzBK és HCEMM kutató és szolgáltató egysége

Vállaljuk fehérjék és fehérjeelegyek kvalitatív és kvantitatív tömegspektrometriás jellemzését, ami az alábbiakat foglalhatja magában:

Mintaelőkészítés

• Fehérje komplexek affinitás izolálása ko-immunprecipitációval

• Fehérjék proteolízise oldatban, vagy gélszeparált mintákban különböző endoproteázokkal (tripszin, kimotripszin, endoproteináz GluC, endoproteináz LysC)

• Magas pH-jú reverz fázisú kromatográfia komplex peptidminták frakcionálására

• Peptidek stabil izotópos jelölése (TMT) relatív mennyiségi meghatározáshoz

• Peptidminták tisztítása C18 szilárd fázisú extrakcióval

• Foszfopeptid izolálás immobilizált fém-affinitás kromatográfiával

Tömegspektrometriás analízis és adatértelmezés

• LC-MS/MS analízis CID, HCD és/vagy ETD fragmentációs technikával

• Fehérje azonosítás adatbázis kereséssel (Protein Prospector, Byonic, Mascot)

• Relatív fehérje mennyiségi meghatározás jelölésmentes és izobár jelöléses (TMT) módszerekkel (Proteome Discoverer, Skyline)

INFRASTRUKTÚRA

Tömegspektrometria

Orbitrap Fusion Lumos Tribrid (Thermo)

Orbitrap Elite (Thermo)

LCQ Fleet (Thermo)

Folyadékkromatográfia

ACQUITY UPLC M-Class system (Waters) – on-line kapcsolva az OT Lumos készülékkel

nanoAcquity UPLC system (Waters) – on-line kapcsolva az OT Elite készülékkel

Jasco és Eldex HPLC rendszerek peptid minták offline frakcionálására

Kérjük vegye fel velünk a kapcsolatot a mintaelőkészítés megkezdése előtt, hogy meghatározhassuk a legmegfelelőbb módszert mintái analíziséhez!