Funkcionális Genomika Laboratórium

Genomikai egység

A huszadik század második feléig a gének funkciójának és szabályozásának tanulmányozása egyedi gének lépésről lépésre történő vizsgálatán alapult. Tekintve, hogy egyre több organizmus genomjának szekvenciája vált és válik teljesen vagy részlegesen ismerté, számos új technika fejlődött ki, melyek a génműködés szisztematikus vagy egyedi analízisét teszik lehetővé. A 2000 óta a HUN-REN Szegedi Biológiai Központban működő Funkcionális Genomika Laboratórium több platformon is lehetőséget kínál génexpresszió egyedi vagy szisztematikus analíziséhez, nukleinsavak (RNS, DNS, mikroRNS, vérben cirkuláló sejt mentes cfRNS), valamint DNS metiláció kvantitatív analízisére. A laboratórium részben tudományos együttműködések keretén belül saját kutatást végez, részben szolgáltatóként működik. Számos együttműködő partnerünk van mind hazai mind külföldi intézetekből.

Legfőbb fejlesztéseink: kevés biológiai mintából történő nukleinsav minta és jel sokszorozási technikák, egysejt RNS szekvenálási módszerek, digitális nukleinsav kimutatási technológiák, génkifejeződéssel kapcsolatos bioinformatikai elemzések.

Az elmúlt öt év genomikával kapcsolatos publikációi:

1. Köhler, Zoltán Márton ; Trencsényi, György ; Juhász, László ; Zvara, Ágnes ; Szabó, P Judit ; Dux, László ; Puskás, G László ; Rovó, László ; Keller-Pintér, Anikó, Tilorone increases glucose uptake in vivo and in skeletal muscle cells by enhancing Akt2/AS160 signaling and glucose transporter levels, JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY 238 : 5 pp. 1080-1094. , 15 p. (2023)

2. Shukla, R.D. ; Zvara, Á. ; Avramucz, Á. ; Biketova, A.Yu. ; Nyerges, A. ; Puskás, L.G. ; Fehér, T., inPOSE: A Flexible Toolbox for Chromosomal Cloning and Amplification of Bacterial Transgenes, MICROORGANISMS 10 : 2 Paper: 236 (2022

3. Tóth, Melinda E. ✉ ; Sárközy, Márta* ✉ ; Szűcs, Gergő ; Dukay, Brigitta ; Hajdu, Petra ; Zvara, Ágnes ; Puskás, László G. ; Szebeni, Gábor J. ; Ruppert, Zsófia ; Csonka, Csaba et al. Exercise training worsens cardiac performance in males but does not change ejection fraction and improves hypertrophy in females in a mouse model of metabolic syndrome BIOLOGY OF SEX DIFFERENCES 13 : 1 Paper: 5 , 20 p. (2022)

4. Váczi, S. ; Barna, L. ; Harazin, A. ; Mészáros, M. ; Porkoláb, G. ; Zvara, Á. ; Ónody, R. ; Földesi, I. ; Veszelka, S. ; Penke, B. et al. S1R agonist modulates rat platelet eicosanoid synthesis and aggregation, PLATELETS 33 : 5 pp. 709-718. , 10 p. (2022)

5. Balogh A, Reiniger L, Hetey S, Kiraly P, Toth E, Karaszi K, Juhasz K, Gelencser Z, Zvara A, Szilagyi A, Puskas LG, Matko J, Papp Z, Kovalszky I, Juhasz C, Than NG. Decreased Expression of ZNF554 in Gliomas is Associated with the Activation of Tumor Pathways and Shorter Patient Survival. Int J Mol Sci. 2020 Aug 11;21(16):5762. doi: 10.3390/ijms21165762. PMID: 32796700; PMCID: PMC7461028.

6. Barna L, Walter FR, Harazin A, Bocsik A, Kincses A, Tubak V, Jósvay K, Zvara Á, Campos-Bedolla P, Deli MA. Simvastatin, edaravone and dexamethasone protect against kainate-induced brain endothelial cell damage. Fluids Barriers CNS. 2020 Feb 10;17(1):5. doi: 10.1186/s12987-019-0166-1. PMID: 32036791; PMCID: PMC7008534.

7. Gyukity-Sebestyén E, Harmati M, Dobra G, Németh IB, Mihály J, Zvara Á, Hunyadi-Gulyás É, Katona R, Nagy I, Horváth P, Bálind Á, Szkalisity Á, Kovács M, Pankotai T, Borsos B, Erdélyi M, Szegletes Z, Veréb ZJ, Buzás EI, Kemény L, Bíró T, Buzás K. Melanoma-Derived Exosomes Induce PD-1 Overexpression and Tumor Progression via Mesenchymal Stem Cell Oncogenic Reprogramming. Front Immunol. 2019 Oct 18;10:2459. doi: 10.3389/fimmu.2019.02459. PMID: 31681332; PMCID: PMC6813737.

8. Bencsik P, Kiss K, Ágg B, Baán JA, Ágoston G, Varga A, Gömöri K, Mendler L, Faragó N, Zvara Á, Sántha P, Puskás LG, Jancsó G, Ferdinandy P. Sensory Neuropathy Affects Cardiac miRNA Expression Network Targeting IGF-1, SLC2a-12, EIF-4e, and ULK-2 mRNAs. Int J Mol Sci. 2019 Feb 25;20(4):991. doi: 10.3390/ijms20040991. PMID: 30823517; PMCID: PMC6412859.

9. Fenteany, Gabriel* ; Gaur, Paras* ; Hegedűs, Lili ; Dudás, Kata ; Kiss, Ernő ; Wéber,Edit ; Hackler, László ; Martinek, Tamás ; Puskás, László G. ; Haracska, Lajos Multilevel structure–activity pro􀅣ling reveals multiple green tea compound familiesthat each modulate ubiquitin-activating enzyme and ubiquitination by a distinctmechanism, SCIENTIFIC REPORTS 9 : 1 Paper: 12801 , 16 p. (2019)

10. Sárközy M, Gáspár R, Zvara Á, Kiscsatári L, Varga Z, Kővári B, Kovács MG, Szűcs G, Fábián G, Diószegi P, Cserni G, Puskás LG, Thum T, Kahán Z, Csont T, Bátkai S. Selective Heart Irradiation Induces Cardiac Overexpression of the Pro- hypertrophic miR-212. Front Oncol. 2019 Jul 16;9:598. doi: 10.3389/fonc.2019.00598. PMID: 31380269; PMCID: PMC6646706.

11. Sárközy M, Gáspár R, Zvara Á, Siska A, Kővári B, Szűcs G, Márványkövi F, Kovács MG, Diószegi P, Bodai L, Zsindely N, Pipicz M, Gömöri K, Kiss K, Bencsik P, Cserni G, Puskás LG, Földesi I, Thum T, Bátkai S, Csont T. Chronic kidney disease induces left ventricular overexpression of the pro-hypertrophic microRNA-212. Sci Rep. 2019 Feb 4;9(1):1302. doi: 10.1038/s41598-018-37690-5. PMID: 30718600; PMCID: PMC6362219.

12. Csajbók ÉA, Kocsis ÁK, Faragó N, Furdan S, Kovács B, Lovas S, Molnár G, Likó I, Zvara Á, Puskás LG, Patócs A, Tamás G. Expression of GLP-1 receptors in insulin-containing interneurons of rat cerebral cortex. Diabetologia. 2019 Apr;62(4):717-725. doi: 10.1007/s00125-018-4803-z. Epub 2019 Jan 12. PMID: 30637442.

Citometriás Egység

A többsejtű szervezetek működéséhez különböző funkcióval rendelkező, specializált sejtek összehangolt működése szükséges. Ennek az egyensúlynak az eltolódása vagy zavara számos betegségben megfigyelhető. A sejtek biológiai funkcióit döntő többségben fehérjék végzik, így nagyon fontos, hogy sejtszinten tudjuk vizsgálni a fehérjék kifejeződését. Erre alkalmas, a már több évtizede elérhető kutatási technika, az áramlási citofluorimetria, mely fluoreszcensen jelölt antitestek segítségével detektálja a sejtek sejtfelszíni és/vagy intracelluláris fehérjéit. Jelenleg egy BC Cytoflex S (4 lézer), egy BD FACSCalibur (2 lézer) analizátorunk és egy BD Jazz (2 lézer) sejtszorterünk van. Azonban az emissziós spektrumai bizonyos fluoreszcens festékeknek átfednek, így csak néhány fehérjére korlátozódik a vizsgálati lehetőség egy mintában. Ennek kiküszöbölésére született meg az egysejt tömeg citometria, mely esetében a vizsgálni kívánt fehérjét felismerő antitestek stabil és min. 96%-os tisztaságú fémizotóppal jelöltek. A detektálás az egysejt tömeg citometria esetében a fém jelölők tömegének mérésén alapul, ezek tömegei nem fednek át, így nagyságrendileg több, kb. 42 marker együttes vizsgálata lehetséges egy sejtből. A tömeg citométer Magyarországon egyedülálló technika a laboratóriumunkban. Nehéz fémizotópokkal konjugált antitest koktélokkal (n=akár 42 marker/minta) n-dimenziós térben komplex fehérje alapú és egysejtszintű bioinformatikai analízist (Cytobank, Astrolabe, Maxpar PathSetter) végzünk.

Vizsgálataink középpontjában az immunrendszer aktivációjának és szabályozásának a zavarai állnak, ezért humán vér és szövetmintákon fehérjeszintű sejtes és molekuláris vizsgálatokat végzünk. Nagy felbontású egysejt tömeg citométerrel immunfenotipizáljuk a human perifériás mononukleáris vagy különböző szövetekből, pl. human primer adenokarcinómából izolált sejteket.

Biológiai mintánként (páciens vs egészséges kontroll) bioinformatikai összehasonlító elemzést követően az egyes alpopulációk összetett expressziós mintázatát kiértékeljük. Az egysejt alapú fehérje vizsgálati módszerek mellett folyadék biopsziák szolubilis mediátorai mennyiségi meghatározása érdekében Luminex (MagPix) és Legendplex (Biolegend) technológiákat állítottuk be. Molekuláris profilt írunk le, mely felfedheti az egyes patológiákra (rheumatoid arthritis, adenokarcinóma, COPD) jellemző mintázatokat, potenciális terápiás célpontokat vagy új diagnosztikai markereket. A patogenitással asszociált jelátviteli utak feltérképezése érdekében immunaktivációt jellemző funkcionális vizsgálatokat állítunk be, ahol immunmoduláló gyógyszerjelölt molekulák szűrhetők.

A laboratóriumunk szolgáltat is és széles hazai és nemzetközi kollaborációs hálózattal rendelkezik kutatócsoportokkal és biotech cégekkel.

Főbb kutatási témáink

• Szisztémás autoimmun (RA, SLE, SSC) betegségek multiparaméteres immunfenotipizálása

• Egysejt tömeg citometriás jellemzése a II- tipusú diabetes gyulladásos szövődményeinek

• A PBMC-ék és plazma fehérjék vizsgálata stabil ill. exacerbáló COPD-ben

• Az intratumor heterogenitás nagy felbontású vizsgálata humán primer adenocarcinomában

• A veleszületett immunitás vizsgálata Drosophila melanogaster mutáns hemocitákban egysejt tömeg citometrival

• Gyógyszerjelölt molekulák hatásának egysejt szintű hatásvizsgálata egysejt tömeg citometriával

A citometriás egység publikációi az elmúlt 5 évből

1. Nikolett Gémes, József Á Balog, Patrícia Neuperger, Erzsébet Schlegl, Imre Barta, János Fillinger, Balazs Antus, Ágnes Zvara, Zoltán Hegedűs, Zsolt Czimmerer, Máté Manczinger, Gergő Balogh, József Tóvári, László G Puskás and Gabor Janos Szebeni, Single cell immunophenotyping revealed the association of CD4+ central-and CD4+ effector memory T-cells linking exacerbating chronic obstructive pulmonary disease and NSCLC Frontiers in Immunology 2023, accepted for publication, IF (2022): 7.30 (Scimago Immunology Q1)

2. Patrícia Neuperger, Klára Szalontai, Nikolett Gémes, József Á Balog, László Tiszlavicz, József Furák, György Lázár, Laszlo G Puskas and Gábor J. Szebeni, Single-Cell Mass Cytometric Analysis of Peripheral Immunity and Multiplex Plasma Marker Profiling of Non-Small Cell Lung Cancer Patients Receiving PD-1 Targeting Immune Checkpoint Inhibitors in Comparison with Platinum-Based Chemotherapy, Frontiers in Immunology 2023 Oct 13:14:1243233. eCollection 2023 IF (2022): 7.30 (Scimago Immunology Q1)

3. Seyyed Ashkan Senobar Tahaei, Ágnes Kulmány, Renáta Minorics, Anita Kiss, Zoltán Szabó, Péter Germán, Gábor J. Szebeni, Nikolett Gémes, Erzsébet Mernyák, István Zupkó, Antiproliferative and antimetastatic properties of 16-azidomethyl substituted 3-O-benzyl estrone analogs Int. J. Mol. Sci. 2023 24(18), 13749; IF (2022): 5.60 (Scimago Medicine Q1)

4. Tamas Kiss; Yaqub Mir; Gergely Stefancsik; Ganbat Gantulga; Aruzhan Askarova; Eva Monostori; Karolina Dulka; Gabor Szebeni; Ádám Nyúl-Tóth; Anna Csiszár, Ádám Légrádi, Galectin-1 as a marker for microglia activation in the aging brain, Brain Research 2023 Aug 7;1818:148517. IF (2022): 2.9 (Scimago Neurology Q2)

5. Gábor J. Szebeni, Róbert Alföldi, Lajos I. Nagy, Patrícia Neuperger, Nikolett Gémes, József A. Balog, László Tiszlavicz, László G. Puskás, Introduction of an ultraviolet C irradiated 4T1 murine breast cancer whole cell vaccine model, Vaccines 2023, 11(7), 1254; IF (2022): 7.80 (Scimago Immunology Q1)

6. Enikő Szabó, Szabolcs Modok2, Benedek Rónaszéki, Anna Faragó, Nikolett Gémes, Lajos I. Nagy, László Hackler Jr., Katalin Farkas, Patrícia Neuperger, József Á. Balog, Attila Balog, László G. Puskás and Gabor J. Szebeni, Comparison of humoral and cellular immune responses in hematologic diseases following completed vaccination protocol with BBIBP-CorV, or AZD1222, or BNT162b2 vaccines against SARS-CoV-2, Frontiers in Medicine, 2023 Jul 17;10:1176168; IF (2022): 3.90 (Scimago Medicine Q1)

7. Viktória Nagy, Raji Mounir, Gábor J. Szebeni, Zsolt Szakonyi, Nikolett Gémes, Renáta Minorics, Péter Germán, Zupkó István, Investigation of anticancer properties of monoterpene-aminopyrimidine hybrids on A2780 ovarian cancer cells, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(13), 10581 IF (2022): 5.60 (Scimago Medicine Q1)

8. Apolka Domokos, Zsofia Varga, Karoly Jambrovics, Noemi Cabllero Sanchez, Eniko Szabo, Gergely Nagy, Beata Scholtz, Laszlo Halasz, Eszter Varadi, Krisztian Bene, Anett Mazlo, Attila Bacsi, Viktoria Jeney, Gabor Szebeni, Laszlo Nagy, Zsolt Czimmerer, The transcriptional control of the VEGFA-VEGFR1 (FLT1) axis in alternatively polarized murine and human macrophages, Frontiers in Immunology 2023 May 4;14:1168635. Research Topic Transcriptional Regulation of Macrophage Function, IF (2022): 7.30 (Scimago Immunology Q1)

9. Hazhmat Ali, Péter Traj, Gábor J. Szebeni, Nikolett Gémes, Vivien Resch, Gábor Paragi, Erzsébet Mernyák, Renáta Minorics*, Istvan Zupko*, Investigation of antineoplastic effects of 13α-estrone sulfamate analogs against the HPV-16 positive human invasive cervical carcinoma cell line SiHa, Int. J. Mol. Sci. 2023Apr 1;24(7):6625. IF (2022): 5.60 (Scimago Medicine Q1)

10. Nikolett Gémes, Zsófia Makra, Patrícia Neuperger, Enikő Szabó, József Á. Balog, Lili Borbála Flink, Beáta Kari, László Hackler Jr., László. G. Puskás, Iván Kanizsai*, and Gábor J. Szebeni* A Cytotoxic Survey On 2-Amino-1H-Imidazol Based Synthetic Ma-rine Sponge Alkaloid Analogues, Drug Development Research, 2022 Dec;83(8):1906-1922. IF (2022): 3.80 (Scimago Drug Discovery Q3)

11. Dániel Honfi, Nikolett Gémes, Enikő Szabó, Patrícia Neuperger, József Á. Balog, Lajos I. Nagy, Gergely Toldi, László G. Puskás, Gábor J. Szebeni* and Attila Balog*, Comparison of homologous and heterologous booster SARS-CoV-2 vaccination in autoimmune rheumatic and musculoskeletal patients, Special Issue: “Immunophenotyping in Autoimmune Diseases and Cancer 2.0” Int. J. Mol. Sci. 2022, 23(19), 11411, IF (2022): 5.60 (Scimago Medicine Q1)

12. Kupai, K.; Várkonyi, T.; Török, S.; Gáti, V.; Czimmerer, Z.; Puskás, L.G.; Szebeni, G.J.* Recent Progress in the Diagnosis and Management of Type 2 Diabetes Mellitus in the Era of COVID-19 and Single Cell Multi-Omics Technologies. Life 2022, 12, 1205, IF (2022): 3.20 (Scimago Biochemistry Q2)

13. Gábor J. Szebeni*, Nikolett Gémes, Dániel Honfi, Enikő Szabó, Patrícia Neuperger, József Á. Balog, Lajos I. Nagy, Zoltan Szekanecz, Laszlo G Puskas, Gergely Toldi, Attila Balog*, Humoral and Cellular Immunogenicity and Safety of Five Different SARS-CoV-2 Vaccines in Patients With Autoimmune Rheumatic and Musculoskeletal Diseases in Remission or With Low Disease Activity and in Healthy Controls: A Single Center Study. Frontiers in Immunology, 2022 Mar 31;13:846248, IF (2022): 7.30 (Scimago Immunology Q1)

14. Melinda E. Tóth; Marta Sarkozy; Gergő Szűcs; Brigitta Dukay; Petra Hajdu; Ágnes Zvara; László G. Puskás; Gábor J. Szebeni; Zsófia Ruppert; Csaba Csonka; Ferenc Kovács; András Kriston; Péter Horváth; Bence Kővári; Gábor Cserni; Tamás Csont; Miklós Sántha Exercise training worsens cardiac performance in males but does not change ejection fraction and improves hypertrophy in females in a mouse model of metabolic syndrome, Biology of Sex Differences, 2022 Jan 31;13(1):5, IF (2022): 7.90 (Scimago Endocrinology Q1)

15. Neuperger, P.; Balog, J.Á.; Tiszlavicz, L.; Furák, J.; Gémes, N.; Kotogány, E.; Szalontai, K.; Puskás, L.G.*; Szebeni, G.J.* Analysis of the Single-Cell Heterogeneity of Adenocarcinoma Cell Lines and the Investigation of Intratumor Heterogeneity Reveals the Expression of Transmembrane Protein 45A (TMEM45A) in Lung Adenocarcinoma Cancer Patients. Cancers 2022, 14, 144. IF (2022): 5.20 (Scimago Oncology: Q1)

16. Szilvia Brunner, Dániel Varga, Renáta Bozó, Róbert Polanek, Tünde Tőkés, Emília Rita Szabó, Réka Molnár, Nikolett Gémes, Gábor Szebeni, László G Puskás, Miklós Erdélyi, Katalin Hideghéty Analysis of ionizing radiation induced DNA damage by superresolution dSTORM microscopy, Pathology & Oncology Research, 2021 Nov 8;27:1609971. IF (2021): 2.874 (Scimago Medicine Q2)

17. Renáta Szabó, Denise Börzsei, Alexandra Hoffmann, Zelma Nadin Lesi, Rudolf Gesztelyi, Béla Juhász, Gábor J. Szebeni, Jasmin Osman, Judith Sebestyén, Arnold Nagy, Sándor Szegedi, Csaba Varga, and Anikó Pósa Lifestyle-induced redox-sensitive alterations: Cross-talk among the RAAS, antioxidant/inflammatory status, and hypertension, Oxidative Medicine and Cellular Longevity, Volume 2021, Article ID 3080863, IF (2021): 7.31 (Scimago Medicine Q1)

18. Ágnes E. Kulmány, Éva Frank, András Szekeres, Gábor J. Szebeni and István Zupkó, Biological Evaluation of Antiproliferative and Anti-Invasive Properties of an Androstadiene Derivative on Human Cervical Cancer Cell Lines, Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, IF (2021): 5.011 (Scimago Clinical Biochemistry Q1)

19. Klára Szalontai, Nikolett Gémes, József Furák, Tünde Varga, Patrícia Neuperger, József Á. Balog, László G. Puskás and Gábor J. Szebeni*, Chronic Obstructive Pulmonary Disease: Epidemiology, Biomarkers and Paving the Way to Lung Cancer, Journal of Clinical Medicine 2021, Special issue: Living with Chronic Obstructive Pulmonary Disease, 2021 Jul; 10(13): 2889. IF (2021): 4.964 (Scimago Medicine Q1)

20. Neuperger Patrícia, Puskás László G., Szebeni Gábor János*, Single cell mass cytometric comparison of human A549 lung and MDA-MD-231 breast adenocarcinoma cellular models, Hungarian Oncology 2021, 2021 Jun 3;65(2):129-138. Scimago Oncology Q4

21. Ágnes E. Kulmány, Éva Frank, Dóra Kovács, Kerstin Kirisits, Georg Krupitza, Patrícia Neuperger, Róbert Alföldi, László G. Puskás, Gábor J. Szebeni and István Zupkó Antiproliferative and Antimetastatic Characterization of an Exo-heterocyclic Androstane Analog Against Human Breast Cancer Cell Lines Biomedicine & Pharmacotherapy 2021 May 19;140:111728, IF (2021): 7.419 (Scimago Medicine Q1)

22. Jozsef A. Balog, Agnes Kemeny, Laszlo G. Puskas, Szilard Burcsar, Attila Balog, * and Gabor J. Szebeni* Investigation of newly diagnosed drug-naive patients with systemic autoimmune diseases revealed the cleaved peptide tyrosine tyrosine (PYY 3-36) as a specific plasma biomarker of rheumatoid arthritis, Mediators of Inflammation, Jun 17;2021:5523582. Special issue: Inflammation and Regional Immune Balance in Autoimmune Disorders IF (2021): 4.529 (Scimago Immunology Q2)

23. Melinda E. Tóth *, Brigitta Dukay, Mária Péter, Gábor Balogh, Gergő Szűcs, Ágnes Zvara, Gábor J. Szebeni, Petra Hajdu, Márta Sárközy, László G. Puskás, Zsolt Török, Tamás Csont, László Vígh, Miklós Sántha, Male and female animals respond differently to high-fat diet and regular exercise training in a mouse model of hyperlipidemia, Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(8), 4198, IF (2021): 6.208 (Scimago Medicine Q1)

24. József Á. Balog, Viktor Honti, Éva Kurucz, Beáta Kari, László G. Puskás, István Andó*, Gábor J. Szebeni*, Immunoprofiling of Drosophila Hemocytes by Single-cell Mass Cytometry, Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2021 Mar 10;S1672-0229(21)00055-3, IF (2021): 6.409 (Scimago Genetics Q1)

25. Kotogány, E.; Balog, J.Á.; Nagy, L.I.; Alföldi, R.; Bertagnolo, V.; Brugnoli, F.; Demjén, A.; Kovács, A.K.; Batár, P.; Mezei, G.; Szabó, R.; Kanizsai, I.; Varga, C.; Puskás, L.G.; Szebeni, G.J. Imidazo[1,2-b]pyrazole-7-Carboxamide Derivative Induces Differentiation-Coupled Apoptosis of Immature Myeloid Cells Such as Acute Myeloid Leukemia and Myeloid-Derived Suppressor Cells. Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 5135.

26. Roberta Fajka-Boja, Gábor J Szebeni, Éva Hunyadi-Gulyás, László G Puskás, Robert Katona, Polyploid adipose stem cells shift the balance of IGF1/IGFBP2 to promote the growth of breast cancer, Frontiers in Oncology, section Molecular and Cellular Oncology, 2020;10:157

27. József Á. Balog,László Hackler Jr.,Anita K. Kovács,Patrícia Neuperger,Róbert Alföldi,Lajos I. Nagy,László G. Puskás and Gábor J. Szebeni, Single Cell Mass Cytometry Revealed the Immunomodulatory Effect of Cisplatin Via Downregulation of Splenic CD44+, IL-17A+ MDSCs and Promotion of Circulating IFN-γ+ Myeloid Cells in the 4T1 Metastatic Breast Cancer Model Int. J. Mol. Sci. 2020, 21(1), 170; 

28. Alföldi R, Balog JÁ, Faragó N, Halmai M, Kotogány E, Neuperger P, Nagy LI, Fehér LZ, Szebeni GJ, Puskás LG. Single Cell Mass Cytometry of Non-Small Cell Lung Cancer Cells Reveals Complexity of In vivo And Three-Dimensional Models over the Petri-dish. Cells. 2019 Sep 16;8(9). pii: E1093. doi: 10.3390/cells8091093. Special Issue: “Single cell Analysis”

29. Gábor J. Szebeni, Lajos I. Nagy, Anikó Berkó, Alexandra Hoffmann, Liliána Z. Fehér, Mária Bagyánszki , Beáta Kari, József A. Balog, László Hackler Jr. ,Iván Kanizsai, Anikó Pósa, Csaba Varga and László G. Puskás The Anti-Inflammatory Role of Mannich Curcuminoids; Special Focus on Colitis, Molecules, Special Issue: “Anti-Inflammatory Activity of Natural Products” 2019, 24(8), 1546

A csoport pályázatai az elmúlt 8 évből

2016-2021 Puskás, GINOP-2.3.2-15-2016-00001: Molekuláris biológiai kutatóműhely az egészség- és környezetvédelem szolgálatában: Társadalmi igényt kielégítő kutatások a kiválósági centrum nemzetközi versenyképességének fokozására, 24 MFt

2017-2019 Puskás, GINOP-2.3.2-15-2016-00028: Kizárólag magas iontartalmú folyadékban oldódni képes, 3D nyomtatásra alkalmas, DNS kódrendszerrel ellátott polimer és az erre alapozott üzletileg hasznosítható UAV-UUV drón hibrid prototípus fejlesztése 31.5 MFt

2016-2021 Puskás, GINOP-2.3.2-15-2016-00030: Gyulladásos és autoimmun kórképek fenotípusos és funkcionális multiparaméteres jellemzése 463.5 MFt

2017-2020 Puskás, GINOP-2.2.1-15-2017-00054: Egyedi genomstruktúrával rendelkező ipari sejtvonal előállítása és alkalmazása 27.8 MFt

2018-2022 Puskás, 2018-1.3.1-VKE-2018-00018: Innovatív, immunrendszert támogató tejtermékek kifejlesztése és hatásvizsgálata 153.8 MFt

2019-2021 Puskás, 2018-1.3.1-VKE-2018-00024: Multiparaméteres immunfenotípus vizsgálat cukorbetegek jellemzésére 88.6 MFt

2019-2020 Szebeni, UNKP-19-4-SZTE-36, Leukocita egysejt tömeg citometriás vizsgálatok kombinálása Legendplex és Luminex plazma citokin vizsgálatokkal Alzheimer-kóros betegekből

2018-2019 Szebeni, UNKP-18-4-SZTE-73, Immunaktiváció és immunreguláció vizsgálata rágcsáló modellekben és humán vérmintákból

2017-2020 Szebeni, BO/00139/17/8, Humán krónikus gyulladásos kórképekben leukociták aktivációjának és polarizációjának vizsgálata, nagy felbontású sejtfelszíni és funkcionális immunfenotipizálása egysejt tömeg citometriával

2020-2021 Szebeni, KDP-2020/1000464 Kooperatív Doktori Program Doktori Hallgatói Ösztöndíj (Balog József Á.) mentor, Egysejt tömeg citometriás immunfenotipizálás humán gyulladásos betegségekben

2021-2024 Szebeni, 2020-1.1.6-JÖVŐ-2021-00003 Befektetés a Jövőbe (SZBK), Krónikus légúti gyulladással járó tüdőbetegek és SARS-CoV-2 fertőzöttek molekuláris fenotipizálása (PI, SZBK, 250 MFt)

2022-2023 Szebeni, Új Nemzeti Kiválósági Program Bolyai + Ösztöndíj, ÚNKP-22-5 -SZTE-535, Ioncsatornák vizsgálata klasszikusan (M1) és alternatívan aktivált makrofágok (M2) polarizációja során

2022-2024 Szebeni, KDP-2021/C1764415 Kooperatív Doktori Program Doktori Hallgatói Ösztöndíj (Gémes Nikolett) mentor, SARS-CoV-2 specifikus immunválasz egysejt alapú funkcionális vizsgálata

2022-2025 Szebeni, Bolyai János kutatási Ösztöndíj, BO00582/22/8, Egysejt tömeg citometriás immunfenotipizálás kombinálása liquid biopsziák multiplex fehérje vizsgálatával gyulladásos betegségekben

2022-2026 Szebeni, FK142877 Az antifoszfolipid szindrómás betegek multiplex immunfenotipizálása és SARS-CoV-2 immunitás vizsgálata (PI, SZBK, 42 M Ft)

2023-2024 Szebeni, Új Nemzeti Kiválósági Program Bolyai + Ösztöndíj, ÚNKP-23-5 -SZTE-694 Akut myeloid leukémiában minimális reziduális betegség asszociált sejtek vizsgálata spektrális áramlási citometriával,