NKFI Alap Pályázatok

 

 

 

 

 

2018-1.3.1-VKE-2018-00026

Molekuláris diagnosztikai fejlesztés alacsony kópiaszámú DNS minták analízisére

Az újgenerációs DNS-szekvenálás technikájának fejlődése napjainkban nemcsak a felfedező jellegű kutatásokat mozdítja elő, hanem forradalmasítja mind a betegségek diagnosztikáját, mind az élelmiszerbiztonsági és környezetvédelmi vizsgálatok megbízhatóságát is. Alkalmazási lehetőségeinek azonban gátat szab, hogy a jelenlegi technikákkal még meglehetősen korlátozott az alacsony mennyiségű DNS-t tartalmazó minták analízise. Ennek a problémának az áthidalására a 2018-1.3.1-VKE-2018-00026 pályázat célja egy olyan technológia és arra épülő szolgáltatás létrehozása, amellyel nagy érzékenységgel tudunk majd különböző genetikai analíziseket végezni, mint pl.:
-betegekből származó minták genetikai elváltozásait kimutatni, segítve ezzel a diagnózist és a hatékonyabb terápiás döntést,
-egysejt DNS-szekvenálást végezni, amely a kutatást és gyógyszerfejlesztést segít,
-élelmiszerminták összetevőinek pontos meghatározását és mikrobiológiai fertőzöttségének mérését elvégezni, amely az élelmiszerbiztonságot szolgálhatja,
-környezeti szennyeződések (víz-, levegő- és talajminták) bakteriológiai elemzését elvégezni.

A 2018-1.3.1-VKE-2018-00026 projekt céljának megvalósításához a konzorciumi partnerek egyrészt egy, az eddigieknél precízebb, ún. molekuláris számlálókon alapuló újgenerációs DNS-szekvenálási technikát fejlesztenek, másrészt egy felhő elérésű bioinformatikai szoftvercsomagot hoznak létre. A konzorciumi partnerek hatékony együttműködésének eredményeként létrejön egy széles körben alkalmazható DNS-diagnosztikai termék és szolgáltatás, amelyre nagy igény mutatkozik mind az orvosi molekuláris diagnosztikát végző vállalkozások és klinikák részéről, mind az élelmiszerbiztonsági és környezetvédelmi szervek felől.

 



Projekt időtartama:
2019.03.01-2022.02.28.

Projekt költségvetése:
1 394 390 620 Ft


Odaítélt támogatás: 952 595 798 Ft


Projekt megvalósítói:
GriffSoft Informatikai Zártkörűen Működő Részvénytársaság
Delta Bio 2000 Kutatási, Fejlesztési, Kereskedelmi és Szolgáltató Korlátolt Felelősségű Társaság
Hiperon Genetics Kutató és Tanácsadó Korlátolt Felelősségű Társaság
Szegedi Biológiai Kutatóközpont


További információ kérhető:
Tim Nóra, projektmenedzser
telefonszám: +36-62-599-745


 

2018-1.3.1-VKE-2018-00024

Innovatív, immunrendszert támogató tejtermékek kifejlesztése és hatásvizsgálata

A 2-es típusú cukorbetegség aránya a fejlett gazdasággal rendelkező országokban meredeken emelkedik, mely elsősorban életmódbeli és genetikai tényezőkre vezethető vissza. Súlyosbító tényezők a túlsúly és mozgáshiány. Leggyakoribb szövődményei a szív-, érrendszeri és vesebetegségek, idegrendszeri problémák, látás romlás, bőr problémák, az Alzheimer-kór gyakoribb előfordulása. A fenti tünetek szerteágazóak és mind a magas vércukorszint közvetlen vagy közvetett következményei. Annak érdekében, hogy megismerjük a mögöttes szisztémás patomechanizmusokat, az egyes szövődmények megjelenésének valószínűségét és a terápiák sikerét prediktálni tudjuk, új markerekre van szükség. A tervezett projekt a cukorbetegek véréből génaktivitási és egysejt felbontású fehérje markerek változásait kívánja megvizsgálni, és ezzel az egyedi, kombinált technológiai megközelítéssel elemezni az egyes betegség alcsoportjait szövődmények és súlyosság szempontjából. A konzorcium többek között a régiónkban egyedülálló, egysejt tömeg citométer előnyeit kívánja kihasználni, mely csak néhány éve elérhető bioanalitikai tömeg citométer, ami egyenként vizsgálja a stabil fémizotópokkal jelölt ellenanyagokkal jellemzett sejteket. A hibrid technológián alapuló tömeg citométer akár 54 különböző marker együttes detektálását teszi lehetővé egysejt citometriás elemzéssel, ezáltal a korábban elvégezhető áramlási citofluoriméter legmodernebb eszközei által elérhető markerek számát többszörösére növeli. A rendszer széles multiplex lehetőségét kihasználva a projekt során ismert, immunsejtekben kifejeződő markerek optimalizálását, újak azonosítását fogjuk elvégezni, amelyek a cukorbetegségben szenvedőket jellemzi, a betegeket osztályozni tudjaés amelyek a szövődmények és a betegség lefolyásával kapcsolatba hozhatók. A konzorcium komplex immunpaneleket is elérhetővé tesz, melyek a későbbiekben új diagnosztikai termékekké fejleszthetők. A konzorciumi tagok a projektben cukorbetegség állatmodelljeit felhasználva a betegség lefolyásának különböző stádiumát is elemezni fogják a vér multiparaméteres immunfenotípus vizsgálatával. Ezt a munkát egy erre szakosodott mikrovállalkozás, a HR-Pharma Kft. fogja elvégezni. Ennek során lehetővé válik a betegség előtti állapot jellemzése, és így korai diagnosztikai jelentősséggel bíró markerek azonosítása is. Az állatkísérletekből származó gén, illetve fehérje marker változásokat az emberi vér sejtjeiben is elemezni fogjuk. A konzorcium vezetője, A TS Labor Kft. különböző immunológiai reagensek felhasználásával a vér nem sejtes elemeinek különböző biokémiai és fehérje paramétereit vizsgálja, majd az immunfenotipizálás eredményeinek ismeretében új, sejt alpopuláció dúsítására alkalmas módszert dolgoz ki, melyeket a projekt során kutatási célra fogunk felhasználni. A konzorcium kisvállalkozás résztvevője, az Avidin Kft. az általa korábban kidolgozott nagy áteresztő képességű, génaktivitási teszten alapuló immunpaneljeit fogja felhasználni az állatkísérletekből kapott vér és szöveti mintáknak, valamint a diabetesben szenvedő betegek vérének tanulmányozására. A konzorcium akadémiai partnere, a Szegedi Biológiai Központ fogja elvégezni az állati és emberi vér egysejt citometriás vizsgálatát. A statikus vérelemzés mellett a levett vér ex vivo aktivitásával az immunsejtek aktiválhatóságának mérétékét is detektálni fogjuk, amely további, aktivációs markerek felfedezéséhez vezethet.

A projekt olyan új fehérjemarkerek azonosítását eredményezheti, amelyek később a standard klinikai diagnosztikában is alkalmazhatóak lehetnek. A projekt újdonságát az adja, hogy eddig korábban nem elérhető felbontásban fogjuk tudni az egyes fehérvérsejt alpopulációk jellemzését elvégezni, ezáltal akár kisebb sejtcsoportban bekövetkező, a betegségre jellemző változást is detektálni tudják, és amelyek akár a cukorbetegség különböző súlyosságát és szövődményeit előre jósolhatják. A konzorciumi tagok a projekt végén egy diabetes fókuszált gén immunpanel prototípus kidolgozását és tesztelését vállalták.



Projekt időtartama:
2018.12.01-2021.11.30

Projekt költségvetése:
647 544 171 Ft


Projekt megvalósítói:
TS Labor Kft.
AVIDIN Kft.
HR - PHARMA Kft.
Szegedi Biológiai Kutatóközpont


További információ kérhető:
Dr. Zvara Ágnes, tudományos főmunkatárs
telefonszám: +36-62-599-782


 

2018-1.3.1-VKE-2018-00018

Innovatív, immunrendszert támogató tejtermékek kifejlesztése és hatásvizsgálata

A projektben olyan innovatív, új tejtermékek kifejlesztését tervezzük, amelyek képesek biológiailag aktív komponensei segítségével az immunrendszert támogatni, és a legyengült szervezetet roborálni. A konzorcium vezetője növényi és gomba eredetű poliszacharidokat fog kefir és joghurt termékekbe keverni, majd állag, íz és stabilitás vizsgálatokat elvégezni, valamint az immunrendszert támogató hatást állatkísérletekben igazolni. Korábban kimutatták, hogy az egyes gabonákban és gombákban megtalálható béta-glükán immunstimuláns hatású, de jótékony hatása van a koleszterinszint csökkentésében, és így a szívérrendszeri megbetegedések, valamint a vastagbélrák kockázatának csökkentésében, krónikus bélgyulladások ellen is, valamint az idegi funkciókra is pozitív hatású. A növényi glükánok mellett az oldható és nem oldható gomba glükánok és komplexeik nem csak, mint prebiotikumok szerepelnek, mint nem emészthető összetett szénhidrátok, melyek közvetlenül stimulálják a jótékony baktériumok osztódását és aktivitását, de közvetlenül immunmoduláló hatásuak is. Így a jelen projektben kifejlesztendő termékcsalád élettani hatását szinergikusan fejti ki: egyfelől a probiotikus baktériumokon keresztül érvényesül, másfelől a direkt immunsejtekre gyakorolt hatással. Ezen felül a béta glükánokat, más cukorpolimerekkel együtt, mint strukturálisan aktív adalékokat az élelmiszeriparban felhasználhatjuk konzisztencia javítóként is stabilizáló, gélképző és sűrítő tulajdonságaik révén. Elsősorban a poliszacharidok biológailag aktív hatásukat kívánjuk kiaknázni, melyet nagyban befolyásol a glükánok elágazási foka, molekulatömege és másodlagos struktúrája. Mindezek alapján a konzorcium többféle eredetű és tulajdonságú glükán és összetett biopolimer molekulát fog hatástanilag és ipari alkalmazhatóságot figyelembe véve letesztelni figyelembe véve a tejtermékben megtalálható többféle probiotikus baktérium jelenlétét, velük kialakított kölcsönhatásukat. Külön hangsúlyt kapnak a különböző tulajdonságú glükánok keverékei. Célunk olyan optimális keverék kidolgozása is, mely már a vékonybél mikrobiotáját is roborálja, majd a vastagbél felső, középső és alsó szakaszára egyre hosszabb láncú, többféle anyag képes eljutni, így támogatva végig a bélrendszer minden szakaszát. Élelmiszer minőségű, szigorúan ellenőrzött hatóanyagokat kívánunk tesztelni. Biokompatibilitási tesztekben a tejtermékek előállításához használt baktériumok, gombák hatását vizsgáljuk a bioaktív anyagokra. Ezt nem csak a késztermékben, hanem a fogyasztás után a tápcsatornában is követni kell. Ezt mesterséges emésztési modellekben fogjuk elvégezni az állatkísérletek előtt. A Synaptogenex Kft korábbi tapasztalaira építve az egyes teszt termékek központi idegrendszeri és bélgyulladásra kifejtett hatásvizsgálatát fogja elvégezni állatokban. A különböző mennyiségű és minőségű poliszacharidot tartalmazó tejtermékek hatását vérből és a bélgyulladási modellben szöveti mintákon is elemezni fogja. A vér biokémiai és immunológia vizsgálatai mellett az érintett szövetek részletes patológiai és nagyfelbontású sejtfenotípus meghatározását is elvégezzük az akadémiai partner, az MTA Szegedi Biológia Központ a rendelkezésére álló speciális immunsejtek állapotának meghatározására, jellemzésére alkalmas technológia segítségével. A kísérleti termékek immunrendszerre gyakorolt hatását is elvégezzük vérből. A gyulladási és vérparaméterek elemzése mellett a bélflórára gyakorolt jótékony hatást is elemezni fogjuk mikrobiológiai és genomikai módszerekkel. A kapott eredmények a tejtermékek optimális összetételére és hatásosságára adnak információt. A konzorcium vezetője a teszt termékek reológiai, íz, stabilitás és mikrobiológiai elemzését végzi el az elkészített és különböző körülmények között tárolt termékekre. Ezen validálási és minőségellenőrzési tesztek eredményei garantálják a kifejlesztett prototípusok piaci, funkcionális tejtermékekké történő fejlesztését.



Projekt időtartama:
2018.12.01-2021.11.30

Projekt költségvetése:
748.837.500 Ft


További információ kérhető:
Dr. Puskás László, tudományos főmunkatárs
telefonszám: +36-62-599-782


 

2018-1.2.1-NKP-2018-00009

Multifunkcionális femtobiológiai munkaállomás kifejlesztése és fényindukált biológiai folyamatok vizsgálata néhány ciklusú spektroszkópiai módszerekkel

A pályázat célja kettős: egyrészt egy nyilvánosan hozzáférhető spektroszkópiai kutatási infrastruktúra létrehozása az ELI-ALPS Lézeres Kutatóközpontban, másrészt, hogy az ELI-ALPS által biztosított néhány ciklusú lézerimpulzusokra felépített spektroszkópiai módszerekkel más berendezéseken hasonló színvonalon nem elvégezhető kísérleteket végezzünk, nemzetközileg is kiemelkedő partnerekkel együttműködve, a fotobiológia alapvető kérdéseinek megválaszolására. A mérőállomások és a kidolgozandó mérési eljárások a felhasználók széles rétegének a rendelkezésére fognak állni a biológiai és az anyagkutatás területén.

A projekt keretében a kialakított munkaállomáson fotoszintetikus fénybegyűjtő komplexek és reakciócentrumok közötti energiaátadás folyamatát tervezzük kutatni a szükséges ultragyors időskálán. Vizsgálni fogjuk továbbá növényi eredetű fotoreceptor fehérjék működését, melyeknek a növények ultraibolya érzékenységével, illetve a fényfüggő növényi egyedfejlődés folyamataival kapcsolatos élettani szerepük van. Nagy időfelbontású EOS méréstechnikával a retinálfehérjék és fotoszintetikus rendszerek gerjesztése során kialakuló primer töltésszétválási folyamatokat kívánjuk tanulmányozni az általuk keltett THz sugárzás illetve lokális térerősség detektálásával.

A Szegedi Biológiai Kutatóközpont, az Európai Unió Kiválósági Központja, két intézetével, a Növénybiológiai és a Biofizikai Intézettel vesz részt a pályázatban. Ez a két intézet már a tervezés szakaszában, az ELI-ALPS tudományos stratégiájának (Scientific Case) kialakításában is tevékenyen részt vett, biofizikai témák kidolgozásával. A konzorciális partner Pécsi Tudományegyetem Fizikai Intézete és Szentágothai János Kutatóközpontja az ELI-ALPS elsődleges THz forrásának tervezője és megépítője, valamint úttörő szerepet játszott – az SZBK Biofizikai Intézete Femtobiológiai kutatócsoportjával együtt – biológiai minták THz-es spektroszkópiájának meghonosításában. A pályázat és az abban foglalt partneri együttműködés ennek a szinergiának további kiaknázását, továbbfejlesztését is célozza.



Projekt időtartama:
2018.09.01-2022.08.31

Projekt költségvetése:
299.999.751 Ft


További információ kérhető:
Dr. Lambrev Petar, tudományos főmunkatárs
telefonszám: +36-62-599-706